Toujours à la recherche de Kaïri, Sora, Donald et Dingo se rendent une nouvelle fois à la Cité du Crépuscule, en quête d'un passage vers le repère de l'Organisation XIII. De son côté, Axel tente de libérer Kaïri, mais se heurte à un Saïx prêt à en découdre. Sora retrouvera-t-il Kaïri et Riku ? Axel reverra-t-il son ami Roxas ? Le temps des retrouvailles adviendra-t-il un jour ?