2045. Suite à une guerre temporelle, dans laquelle le passé et l'avenir du Japon se sont mélangés, le Japon s'est fractionné en de nombreuses îles qui se trouvent aux mains de différents chefs de guerre. En l'an 22 de Père Taishô, un bateau de recherche emportant Shôichi, le protagoniste de cette aventure, quitte Nagasaki. Il se fait attaquer par une flotte de samouraïs. L'arrivée du vaisseau Yumihari sauve Shôichi. Mais ce dernier doit bientôt affronter une armée de guerriers de terre, puis des géants... À mesure que le Yumihari avance, Shôichi se retrouve impliqué dans des combats contre toutes sortes de guerriers, des combats qui dépassent le temps!