Après la trahison de Kratos, c'est maintenant Zélos qui se retourne contre Lloyd! L'élu de Tethe'alla livre Colette à Mithos qui, en réalité, n'est autre que le chef suprême du Cruxis... C'est non seulement le sort de la jeune fille, mais aussi le destin des deux mondes qui repose désormais entre les mains de Lloyd et de sa petite bande. Il leur faut mettre la main au plus vite sur l'épée éternelle, seule capable de rendre à la planète son état originel. Mais pour l'obtenir, Lloyd va devoir se battre contre son propre père, le mystérieux Kratos... Et défier le redoutable Mithos Yggdrasill!