Emmenés par Dark Krayt, les Sith dirigent à nouveau l'empire. Débarrassés de la règle de deux, ils sont désormais légions. Cependant, les derniers Jedi, l'alliance galactique et les fidèles à l'ancien empereur Roan Fel, empêchent encore leur domination totale de la galaxie. Dans l'espoir de piéger Roan Fel en dehors de bastion, sa retraite imprenable, les Sith capturent sa fille, Marasiah Fel. Leurs plans se heurtent alors au ralliement inattendu de chevaliers impériaux, des Jedi et d'un chasseur de primes nommé Cade Skywalker. Déterminés à en savoir plus au sujet du dernier descendant de la lignée des Skywalker, les Sith mettent tout en oeuvre pour le localiser. Le futur de Star Wars débute avec cette série située environ 140 ans après l'Épisode IV : Un nouvel espoir.