L'un des plus zélés défenseurs de l'empire, l'amiral Thrawn, a pris les commandes de ce qui reste de la flotte impériale afin de lancer une attaque massive contre la jeune république. Pendant ce temps, Han Solo et Lando Calrissian, lancés à la poursuite d'un traître, se retrouvent face a des milliers de vaisseaux menaçants... Mais un autre péril guette les héros de l'alliance alors qu'un Jedi noir, allié de Thrawn, a juré de corrompre Luke, Léia et ses deux jumeaux à naître, en les faisant passer du côté obscur de la force.