Alors qu'il traverse un cimetière pour prendre un raccourci, le jeune lycéen Manta Oyamada découvre qu'il a la faculté de voir et d'entendre les fantômes qui n'ont pas encore rejoint l'au-delà. Sa surprise ne s'arrête pas là, puisqu'il fait à cette occasion, la connaissance de Yoh Asakura, un autre jeune garçon à l'allure nonchalante qui se révèle être un Shaman. L'effet de surprise passé, Manta accepte ses nouvelles facultés sensorielles et devient le compagnon de Yoh. Les aptitudes de Yoh lui permettent de communiquer avec les esprits et de les aider lorsqu'ils en ont besoin: en leur prêtant son enveloppe charnelle, Yoh acquiert leurs pouvoirs et leur offre parfois la possibilité d'accomplir un acte dont la mort les a privés.