Au lycée Hakoniwa, les élèves peuvent exprimer leurs préoccupations à chaque heure de la journée et sept jours sur sept en les déposant par écrit dans la boîte à réclamations, la Médaka-Box! Le combat quotidien de la présidente du Conseil Etudiant, Médaka Kurokami, pour résoudre les problèmes des élèves est sur le point de commencer!!