Shinji Ikari est un collégien tout ce qu'il y a de plus normal. Mais à partir du jour où il découvre une mystérieuse sphère appelée "core", son quotidien s'en trouve bouleversé, y compris celui de ses camarades de classe Rei Ayanami, Asuka Langley Soryu, et Kaoru Nagisa, nouvellement arrivé dans l'école... Quel sera le destin de Shinji désormais confronté aux assauts successifs des "Anges"?! Voici le début d'une toute nouvelle aventure écolière d'Eva, aux sensations inédites!