Résumé :

Le sort a réuni dans un même endroit Naoto, Magato, Freuling et Heine. Freuling est en réalité "l'autre Naoto" ! De son côté, Naoto, apprenant la vérité sur le massacre qui hante toujours sa mémoire, est probablement choqué, et sa réaction est fulgurante. Neubauten, le directeur du bureau administratif central des affaires générales, a ordonné que les lignes ferroviaires soient coupées et a ainsi isolé la ville souterraine.
Lorsqu'Einstellsehn, la directrice du centre expérimental souterrain, réalise ce qu'il a fait, elle décide d'agir à son tour.