Après la ratification de la charte de la Fédération des Nations unies, l'ordre des Chevaliers noirs marche sur l'Area 11, pour rétablir le Japon dans ses droits. Mais le nouveau gouverneur qui apparaît devant Lelouch, n'est autre que Nunnally! Pour la sauver, il va devoir s'adresser à Suzaku, son ex-meilleur ami, devenu son plus farouche adversaire depuis la mort d'Euphie!