En tant que possesseur de Geass combattant le Saint-Empire de Britannia, Lelouch a compris qu'il ne pourrait pas rester éternellement auprès de sa petite soeur, Nunnally. Il souhaiterait que son meilleur ami, Suzaku, remplisse ce rôle à sa place et devienne son ange gardien. Mais la lutte s'intensifie entre Lelouch, qui sous le masque de Zero, a formé l'ordre des Chevaliers noirs pour résister de plus belle à l'invasion de l'Empire, et Suzaku, qui ne cesse de prendre du galon dans l'armée d'occupation...