Pourquoi Desmond Miles est-il prisonnier d'un laboratoire expérimental secret et ultrasécurisé? Que cherchent les mystérieux scientifiques qui s'acharnent sur lui? Quel formidable secret recèle sa mémoire génétique, enfoui tout au fond de son ADN? Pourquoi ainsi fouiller dans le passé des ancêtres de Desmond, qui tous appartenaient à la secte des Assassins? Ne savent-ils pas qu'il est dangereux de réveiller la mémoire d'un Assassin?